1.物流配送基础设施和配送管理手段落后

    物流配送基础设施落后，电子化、信息化程度较低。包厂运输运输网络的建设、配送中心的规划与管理、仓储设施的现代化配置、配送运输工具的更新换代、物流管理模式和经营方式的优化等等的不到位严重阻碍了电子商务和现代物流的协同发展。

    2.管理体制和管理水平存在不足

    物流企业内部的管理能力、组织设置、技术水平、甚至包括企业文化和道德观念的改变却与物流需求存在差距。珠三角货物运输传统物流企业的运作模式使得物流企业内部流程长而繁琐，从订单接收到结算，相关环节各自为政，一个订单的整个操作过程分为了几个部门区间化管理，如接力棒般一个传一个，经手的人员和岗位多，流程长且易出错，内部运营效率大打折扣。组织、岗位和部门设置存在较大的优化空间。

    3.标准化和信息化工作跟不上物流发展的需要

    比如信息系统之间缺乏接口标准，深圳到凭祥专线电子商务企业内部物流信息系统与第三方物流信息系统之间缺乏有效衔接，运输信息系统、仓储信息系统、物流作业管理信息系统之间无法完全对接与沟通，人为的增加了不必要的沟通成本。

    4.物流人才稀缺

    从业人员是否具有较高的电子商务和现代物流知识和操作经验，直接影响到企业的生存与发展。我国缺乏一定规模的物流教育系统，设置物流相关课程的高校并不多，物流行业相关人才培养和输送受到制约。